Ingénieur de recherche en bioinformatique (M/F)
Les projets
L'objectif du premier projet est de caractériser les différentes populations de cellules tumorales présentes dans les TVIM, avec un intérêt particulier pour les tumeurs basales. L'objectif sera d'identifier leurs voies de signalisation sous-jacentes et les facteurs de transcription clés contrôlant leur identité ainsi que les relations entre ces populations de cellules tumorales et avec les cellules non tumorales (existence de boucles paracrines) et leur contribution à la résistance au traitement.
Le/la candidat-e sera chargé-e d'analyser toutes les données omiques à grande échelle (bulk, cellule unique et spatiale) de la qualité du contrôle à la visualisation et à l'interprétation des données. Le/la candidat-e intégrera également les différentes données omiques et les données cliniques pour mieux comprendre la résistance au traitement. L'objectif principal du deuxième projet est d'identifier à partir de données de séquençage des exomes des signatures moléculaires d'exposition environnementale, y compris professionnelle.
Cancer de la vessie, tumeurs basales, réseau de régulation génique, séquençage ARN sur cellule unique, transcriptomique spatiale, criblage de type PERTURB-seq, résistance au traitement, microenvironnement, EGFR, chimiothérapie, séquençage d’exomes complet, épidémiologie moléculaire, exposition environnementale.